共存于厭氧真菌分離培養(yǎng)液中瘤胃甲烷菌的檢測(cè)及其多樣性分析

對(duì)分離自山羊瘤胃的真菌分離培養(yǎng)液中甲烷菌進(jìn)行16S rDNA擴(kuò)增、DGGE分析、RFLP及測(cè)序分析,研究共存于真菌分離培養(yǎng)液中甲烷菌的種類及其多樣性.DGGE結(jié)果顯示:從厭氧真菌分離至第45代,甲烷菌多樣性指數(shù)由1.32降至0.99,相似性最低為34.7%;第45代至62代,多樣性指數(shù)由0.99升至1.15,相似性最低為89.2%.RFLP多態(tài)性分析69個(gè)克隆共得到5個(gè)操作分類單元,選擇其中6個(gè)具有代表性的序列進(jìn)行測(cè)序.序列及系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,屬于其中3個(gè)操作分類單元的克隆最相似菌都是Uncultured archaeal symbiont PA202,相似性均為95%,沒有與這些克隆相似性較高的已培養(yǎng)甲烷菌;屬于另外2個(gè)操作分類單元的克隆最相似菌都是Uncultured rumen methanogen 956,相似性均為97%,最相似已知菌為Methanobrevibacter sp. NT7,相似性為97%.結(jié)果表明,真菌培養(yǎng)液中存在目前尚未分離培養(yǎng)的瘤胃甲烷菌.

作 者： 成艷芬 毛勝勇 裴彩霞 劉建新 朱偉云 CHENG Yan-fen MAO Sheng-yong PEI Cai-xia LIU Jian-xin ZHU Wei-yun   作者單位： 成艷芬,毛勝勇,裴彩霞,朱偉云,CHENG Yan-fen,MAO Sheng-yong,PEI Cai-xia,ZHU Wei-yun(南京農(nóng)業(yè)大學(xué)消化道微生物研究室,南京,210095)

劉建新,LIU Jian-xin(浙江大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,杭州,310029) 

刊 名： 微生物學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA MICROBIOLOGICA SINICA  年，卷(期)： 2006 46(6)  分類號(hào)： Q93  關(guān)鍵詞： 厭氧真菌   甲烷菌   DGGE   RFLP  

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